Consiguen perfeccionar la base de datos genómica mundial Gencode
BARCELONA, 6 Nov. (EUROPA PRESS) -
Un equipo internacional de científicos, liderado por el Centre de Regulació Genòmica de Barcelona (CRG), ha desarrollado un nuevo método que describe nuevos genes en la 'materia oscura' del ADN y permite mapear de forma más precisa, rápida y económica, ha publicado la revista 'Nature Genetics'.
Este método ha permitido mejorar la que está considerada como la base de datos genómica referente a nivel mundial para los genes codificantes en los genomas de humano y ratón, Gencode, y en la investigación, el CRG ha colaborado con el Cold Spring Harbor de Nueva York, el Wellcome Trust Sanger Institute de Hinxton, y la empresa qGenomics en Barcelona.
La información de la secuencia del genoma humano es primordial para la investigación biomédica, pero todavía no existe un mapa detallado de todos los genes que se encuentran codificados en el genoma: en concreto, no se cuenta con información detallada de la región conocida como 'materia oscura', que corresponde a genes que no codifican para proteínas.
En estas regiones de 'materia oscura' hay unos genes poco conocidos, llamados 'ARN largos no codificantes', que están relacionados con varias enfermedades.
"El 98% de nuestro ADN no codifica para proteínas. Estas regiones de ADN contienen miles de genes no codificantes que no están caracterizados y todavía queda un largo camino hasta que comprendamos sus funciones y su papel en las enfermedades", y para ello se necesitan mapas completos de todos los genes, según el codirector del trabajo Rory Johnson --actualmente de la Universidad de Berna--, ha explicado el CRG en un comunicado.
ESPECÍFICO PARA REGIONES
La principal característica de este nuevo método --llamado RNA Capture Long Seq (CLS)-- es que se centra específicamente en las regiones no codificantes del genoma, que se han amplificado y analizado mediante técnicas avanzadas de secuenciación.
"Hemos podido producir un mapa detallado de más de 3.500 ARN largos no codificantes en humanos y ratones. Y eso nos ha permitido describir las características genómicas de ARN largos no codificantes para comprender mejor cómo funcionan", han explicado los primeros autores del trabajo en el CRG, Julien Lagarde y Barbara Uszczynska.
CONTRIBUCIÓN MUNDIAL
Los investigadores y los colaboradores han permitido mejorar "sustancialmente" los catálogos de genes, y en concreto los de ARN largos no codificantes.
"Científicos en todo el mundo están utilizando Gencode para sus proyectos de investigación como datos de referencia. Así que mejorar GENCODE, implica contribuir a la investigación biomédica mundial" y beneficiar a toda la sociedad, ha afirmado el colíder del trabajo y coordinador del programa de Bioinformática y Genómica en el CRG, Roderic Guigó --que inició Gencode en 2003, al participar en el proyecto Encode--.
