KUALA LUMPUR, Malaisia, April 24 /PRNewswire/ --
Synamatix ha anunciado hoy el lanzamiento de dos nuevas aplicaciones de software diseñadas para procesar y analizar datos de proyectos de resecuenciación a gran escala realizados con plataformas de secuenciación de ADN de segunda generación.
Robert Hercus, director administrativo de Synamatix, comentó: "SXOligosearch(TM) y una versión modificada de SynaSearch(TM) han sido lanzadas para tratar la creciente explosión de datos del mayor uso de las plataformas de secuenciación de ADN 454-Roche y Solexa-Illumina. Estas aplicaciones fueron desarrolladas como parte de una estrategia en marcha para completar una serie de aplicaciones de alta producción para procesar, analizar e integrar datos de cada tipo de secuenciador de ADN de segunda generación".
La principal aplicación, SXOligosearch, está diseñada para mapear secuencias cortas como lecturas del secuenciador de genoma Solexa-Illumina o sondas de microserie oligonucleótidas. Ofrece un grado muy alto de flexibilidad en términos de manejo de una amplia variedad de errores de lectura o mutaciones. Además, se ha mejorado 100 veces el rendimiento en comparación con herramientas convencionales. A diferencia de otras herramientas de alineación estándares de la industria, SXOligosearch alinea las lecturas completas en lugar de HSPs resultando en una especificación y sensibilidad más altas. También es capaz de manejar lecturas de baja calidad que contienen una serie de no correspondencias, inserciones o eliminación con alta precisión y rendimiento superior.
Una nueva versión de SynaSearch, modificada para procesar y mapear lecturas de las plataformas GS20 y FLX desde 454, ya ha sido presentada. La optimización cuidadosa ha resultado en una mayor precisión, especificad y un rendimiento 200 veces mejor del de los planteamientos estándares.
Utilizando SynaBASE(TM) como una plataforma común, pueden combinarse varios tipos de lecturas para aumentar la cobertura y profundizar el apoyo en cuanto a las diferencias que se identifican entre los conjuntos de datos.
Otras aplicaciones de alto rendimiento de Synamatix basadas en SynaBASE, su plataforma de base de datos de red estructurada única, son SynaTree(TM), SXPRESearch(TM) y SXProbeDB(TM).
Acerca de Synamatix
La tecnología fundamental que describe las aplicaciones de software Synamatix es propiedad de la plataforma "SynaBASE". Las aplicaciones creadas sobre la plataforma de esta base de datos muestran una mejora muy significativa en cuanto a la escalabilidad, sensibilidad y rendimiento. Synamatix es una compañía privada de bioinformática de próxima generación cuyas principales actividades se basan en la I+D relativa a su tecnología central, desarrollo de nuevas aplicaciones de software y el apoyo de su base de usuarios en EE.UU., Europa, Asia y Australia.
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